Wariant wirusa występujący w Południowej Afryce może być oporny na przeciwciała

Według wczesnych danych przeciwciała przeciwko nowemu koronawirusowi mogą nie działać tak dobrze przeciwko nowemu wariantowi wirusa zidentyfikowanemu w Republice Południowej Afryki.

Naukowcy ostatnio wyrazili obawy, że wariant, znany jako 501.V2, może być odporny na szczepionki COVID-19, donosi Live Science. Eksperci zauważyli, że wariant zgromadził znaczną liczbę mutacji w swoim białku kolczastym [ang.spike protein], spiczastej strukturze, która odrywa się od powierzchni wirusa i wiąże się z komórkami ludzkimi, wywołując infekcję.

Autoryzowane szczepionki są ukierunkowane na to białko kolczaste, więc jeśli ulegnie znacznej mutacji, szczepionki mogą nie zapewniać takiej ochrony. Podobnie, leki zawierające przeciwciała i przeciwciała, które ludzie naturalnie wytwarzają, gdy złapią COVID-19, mogą również być mniej chroniące przed takim mutantem.

Teraz nowe badanie opublikowane 4 stycznia w bazie danych preprintów bioRxiv sugeruje, że może tak być w przypadku 501.V2. W badaniu, które nie było recenzowane, stwierdzono, że specyficzne mutacje w białku kolczastym czynią ten wariant mniej wrażliwym na przeciwciała niektórych ludzi – ale co najważniejsze, te mutacje nie sprawiają, że nowy wariant jest niezwyciężony, tylko mniej podatny na atak. Dodatkowo, podczas gdy przeciwciała niektórych ludzi nie mogły dobrze wiązać się z wariantem, przeciwciała innych nadal dobrze wiązały się z mutantem.

“Istnieje duże zróżnicowanie między osobami w zakresie wpływu mutacji na wiązanie i neutralizację przeciwciał w surowicy”, co oznacza, jak dobrze przeciwciała powstrzymują wirusa przed zakażeniem komórek, pisali autorzy. Jednakże, mutacje w jednym miejscu na białku kolczastym – zwanym E484 – wyróżniały się jako potencjalny problem. Dla niektórych osób mutacja w E484 oznaczała ponad 10-krotny spadek zdolności przeciwciał do blokowania wirusa przed wejściem do komórek.

Niestety, 501.V2 ma mutację w miejscu E484, „podobnie jak niektóre inne izolaty z innych miejsc” – zauważyli autorzy w tweecie. Oznacza to, że wariant może być mniej podatny na przeciwciała niektórych ludzi i leki zawierające przeciwciała, ale potrzeba więcej badań, aby dowiedzieć się, czy przeciwciała wytwarzane przez szczepionki będą podobnie dotknięte – dodali autorzy.

Zespół doszedł do tych wniosków poprzez powiększenie “domeny wiążącej receptory” (RBD) białka kolczastego, części kolca, która bezpośrednio wiąże się z powierzchnią komórki. Według badań opublikowanych 12 listopada w czasopiśmie Cell, przeciwciała występują w różnych wariantach, a te, które są ukierunkowane na RBD, są najbardziej krytyczne dla neutralizacji koronawirusa. Z tego powodu mutacje w RBD mogą pomóc nowym wariantom uniknąć układu odpornościowego – zauważyli autorzy.

Zespół zmapował, jak różne mutacje w RBD wpłyną na jego strukturę, a tym samym na zdolność przeciwciał do wiązania się z nim; następnie zmodyfikowali genetycznie komórki drożdży, aby wyhodować zmutowane RBD na ich powierzchni. W eksperymentach zwanych „testami neutralizującymi” zespół wystawił zmutowane drożdże na działanie surowicy krwi, płynnej części krwi zawierającej przeciwciała; próbki te pobrano od osób, które wyzdrowiały z COVID-19 i wytworzyły przeciwciała przeciwko wirusowi.

Zespół przeprowadził również testy z syntetycznymi wirusami, zwanymi pseudowirusami, które przypominały SARS-CoV-2 i były także wyposażone w zmutowane RBD, podobnie jak drożdże. Te pseudowirusy inkubowano z komórkami ludzkimi i przeciwciałami, z których pobrano próbki, w celu sprawdzenia, czy przeciwciała powstrzymały zakażenie komórek.

Średnio mutacje w miejscu E484 wykazywały największy wpływ na wiązanie przeciwciał i neutralizację wirusa. To powiedziawszy, na poziomie indywidualnym, „kilka próbek nie było zasadniczo dotkniętych mutacjami E484”, a inne mutacje okazały się większym problemem, jak zauważył zespół w swoim artykule. Na przykład, niektóre próbki pobrane od ozdrowiałych pacjentów nie wiązały się tak dobrze z RBD z mutacjami w tak zwanej „pętli 443-450”, strukturze, do której celuje również koktajl przeciwciał Regeneron, zwany REGEN-COV2.

Gdy dowiemy się więcej o wpływie różnych mutacji na odporność SARS-CoV-2, ważne będzie, aby przeprowadzić podobne badania również z przeciwciałami wytwarzanymi przez szczepionkę – zauważyli autorzy. Na szczęście nawet mutacje E484 osłabiły aktywność neutralizującą tylko niektórych badanych próbek krwi i nie zniszczyły one całkowicie mocy przeciwciał w żadnej – napisali autorzy. To zwiększa prawdopodobieństwo, że dostępne szczepionki zachowają swoją przydatność „przez dłuższy czas” – napisali.

Podczas gdy nadal monitorujemy wariant 501.V2, priorytetem powinno być teraz zaszczepienie jak największej liczby osób, powiedział 5 stycznia dr Scott Gottlieb, były komisarz Food and Drug Administration, poinformował CNBC .

„Nowy wariant zmutował część białka kolczastego, z którym wiążą się nasze przeciwciała, aby spróbować usunąć wirusa, więc jest to niepokojące” – powiedział Gottlieb. „Szczepionka może teraz stać się blokadą przeciwko tym wariantom, naprawdę zyskując mocniejszy punkt zaczepienia tutaj, w Stanach Zjednoczonych, ale musimy przyspieszyć tempo szczepień” – powiedział.

Źródło: Nicoletta Lanese

How Do Vaccines Work?

COVID-19 vaccines may not work as well against South African variant, experts worry

What is a coronavirus?

What are antibodies?

Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodies

What Are Viruses?

Mapping Neutralizing and Immunodominant Sites on the SARS-CoV-2 Spike Receptor-Binding Domain by Structure-Guided High-Resolution Serology

Immune System: Diseases, Disorders & Function

South African Covid variant appears to ‘obviate’ antibody drugs, Dr. Scott Gottlieb says

Zdjęcie: Shutterstock

Subscribe
Powiadom o
guest
0 komentarzy
Inline Feedbacks
View all comments
0
Would love your thoughts, please comment.x
()
x